3046年，光之国与影之国之间的战争最终到了尽头，然而宇宙的世纪大战也即将爆发，以光之国为首的奥特兄弟决定誓死守护光之国，另一方面，以影之国为首的影之战士决定把光之国所有的奥特战士全部消灭，离开光之国已有多年的高斯奥特曼在M46星与自己多年未见的父亲风影斯奥特曼再次相见，与自己多年未见的父亲这次是带着一个不好的消息来找自己的，高斯问他是什么不好的消息，风影斯告诉他这个不好的消息后就离开了,风影斯走后，高斯回想起自己父亲刚刚说的不好的消息后，高斯知道自己将面对比以前更强大的影之国以及光之国的死对头魔暗斯奥特曼，同时自己也将联手光之国的其他奥特战士和昔日一起并肩战斗的同伴们对抗影之国。